Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syce1Q9D495 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syce1Q9D495 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms