Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhc2Q9D485 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms