Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap53Q9D439 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap53Q9D439 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.6 ms