Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933421I07RikQ9D420 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933421I07RikQ9D420 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms