Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx29Q9D3S3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx29Q9D3S3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms