Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D3J9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms