Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rufy3Q9D394 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rufy3Q9D394 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms