Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms