Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx20Q9D2Y5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms