Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms