Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms