Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SarnpQ9D1J3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms