Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D1F3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1F3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D1F3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms