Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TbcbQ9D1E6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TbcbQ9D1E6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms