Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syf2Q9D198 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syf2Q9D198 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms