Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd3Q9D176 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms