Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem53Q9D0Z3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms