Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exosc7Q9D0M0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms