Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2e1Q9D0D5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms