Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shmt2Q9CZN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms