Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms