Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx7Q9CY18 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms