Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nip7Q9CXK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms