Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed5Q9CXE7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed5Q9CXE7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms