Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mcm8Q9CWV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms