Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn1Q9CWM4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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