Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud1Q9CUB6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms