Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhobtb3Q9CTN4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms