Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda2Q9CRC9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms