Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CRC3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9CRC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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