Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR55 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR55 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CR55 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CR55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CR55 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CR55 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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