Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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PpidQ9CR16 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PpidQ9CR16 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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PpidQ9CR16 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PpidQ9CR16 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PpidQ9CR16 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpidQ9CR16 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PpidQ9CR16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms