Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmd9Q9CR00 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd9Q9CR00 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms