Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms