Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700129C05RikQ9CQ77 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700129C05RikQ9CQ77 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms