Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpa3Q9CQ71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms