Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms