Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prpf8Q99PV0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms