Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim26Q99PN3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms