Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2a1Q99PM3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms