Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scd3Q99PL7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scd3Q99PL7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms