Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rassf3Q99P51 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rassf3Q99P51 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms