Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b1Q99NB9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b1Q99NB9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms