Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcam1Q99NB3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcam1Q99NB3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms