Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atoh8Q99NA2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atoh8Q99NA2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms