Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hdac9Q99N13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms