Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cstf3Q99LI7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cstf3Q99LI7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms