Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnpo2Q99LG2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnpo2Q99LG2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms