Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pagr1aQ99L02 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms