Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q99KU6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q99KU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q99KU6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q99KU6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q99KU6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q99KU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q99KU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q99KU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms